A história centra ao redor de um planeta onde a população local, conhecida como Smarties (uma raça muito semelhante a gnomos, que gostam muito de festejar e beber), são constantemente oprimidos pelos Sea Reapers. Também residindo nesse planeta está um gigante chamado Kabuto que é considerado uma grande ameaça.

Essa é a hostil situação a que os Meccaryns são introduzidos quando eles colidem no planeta. O jogo é dividido em três seções, onde o jogador controla um dos três lados em cada seção: uma como os Meccaryns, outra como a princesa Sea Reaper rebelde Delphi, e a parte final como um Kabuto.

No primeiro lançamento de Giants, o jogo foi censurado por dar um alto índice de violência e conteúdo sexual. As mudanças foram feitas no sangue dos Sea Reaper, trocando a cor do mesmo de vermelho para verde, e nas véstias de Delphi, pois ela não possuia nada mais do que uma saia, deixando seus seios à mostra. Na mudança, ela passou a usar um biquini em conjunto da saia.

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